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川金丝猴（Rhinopithecus Roxellanae）种群遗传结构和分子系统地理学初步研究

作者：缑敬轩 Publish: 2004-9-9 Hits:-

【中文题名】

川金丝猴（Rhinopithecus Roxellanae）种群遗传结构和分子系统地理学初步研究

【英文题名】

Primer Genetic Structure and Molecular Phylogeography of Sichuan Snub-nosed Monkey (Rhinopithecus Roxellanae)

【学科专业】

动物学

【论文级别】

硕士论文

【投稿时间】

2004-9-9

【中关键词】

川金丝猴,种群遗传结构,分子系统地理学,线粒体控制区,核苷酸多态性,单倍型

【英关键词】

Sichuan snub-nosed monkey （Rhinopithecus roxellanae）, genetic structure,Molecular Phylogeography, mitochondria DNA control region, nucleotide divergence,

【分类导航】

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【论文摘要】

川金丝猴为我国所特有的灵长类动物，它隶属于灵长目(Primates)猴科(Cercopithecidae)仰鼻猴属(Rhinopithecus)。作为一种树栖动物，其栖息地与森林植被有密切的关系。但由于人类对森林的砍伐和过度开发以及其他原因，川金丝猴过去连成大片的分布格局被分割缩小，形成现在这种不连续的岛状分布格局，整个川金丝猴的个体数量也急剧下降。为了采取有效的保护措施，有必要从遗传学的角度来探讨它的种群结构，遗传多样性以及种群的演变历史和影响因素。但是目前关于川金丝猴的保护生物学研究主要集中在对其生态环境的研究方面，相关的保护遗传学方面的研究还很少。因此我们利用分子生物学技术探讨了川金丝猴的种群遗传结构及其分布格局形成的历史。本研究以变异速率比较快的线粒体控制区作为遗传标记，比较了来自四川、甘肃、陕西和湖北神农架等地60个个体的序列差异，发现12种单倍型，其变异位点占整个碱基数的14.2％。整个群体的核苷酸多样性为0.033，比大熊猫的核苷酸多样性(0.06)还低。这种贫乏的遗传多样性说明川金丝猴可能在历史上经历过严重的瓶颈效应。通过不同方法构建的系统发育树也证明了这一点。最小跨度树直观的显...

【论文题纲】

中文摘要	5-6
Abstract	6-7
1 研究背景	7-16
1.1 川金丝猴(Rhinopithecus roxellanae)研究概述	7-10
1.1.1 川金丝猴简介	7-8
1.1.2 川金丝猴的数量分布和保护遗传学研究现状	8-10
1.2 遗传多样性	10-13
1.2.1 遗传多样性简介	10-12
1.2.2 非损伤性取样及在保护遗传学研究中地位	12-13
1.3 分子系统地理学简介	13-14
1.4 嵌套式PCR(Nested PCR)简介	14
1.5 本研究的目的意义及设想	14-16
2 材料与方法	16-22
2.1 样品的采集和保存	16
2.2 主要试剂和仪器	16-17
2.2.1 主要试剂	16-17
2.2.2 主要仪器设备	17
2.3 实验方法	17-21
2.3.1 基因组总DNA的提取	17-20
2.3.2 PCR扩增方法	20-21
2.3.3 序列测定	21
2.4 序列分析	21-22
3 实验结果	22-28
3.1 不同样品中总DNA的提取与扩增	22-23
3.2 DNA序列及其差异	23
3.3 群体遗传结构	23-26
3.4 系统地理学	26-28
4 讨论	28-33
4.1 不同样品中总DNA的提取	28-29
4.2 单倍型和群体分化(群体遗传结构)	29-30
4.3 系统地理学	30-31
4.4 保护遗传学	31-33
5 结论	33-34
参考文献	34-42
致谢	42-43
硕士期间已发表文章	43

【DOI】

LunWen.ID:2.2008.33975



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