| 【中文题名】 | 原核生物翻译起始区的序列特征及基因间的关联特性 |
| 【英文题名】 | The Character of Sequence in Translation Start Region and the Correlation Properties Among Genes in Prokaryote |
| 【学科专业】 | 生物物理学 |
| 【论文级别】 | 硕士论文 |
| 【投稿时间】 | 2004-9-16 |
| 【中关键词】 | L-Ter,SD序列,信息聚类,相对使用频率,关联强度,基因表达水平 |
| 【英关键词】 | L-Ter, SD sequence, information clustering, Relative Frequency, correlation intension, gene expression level, |
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| 【论文摘要】 | 本文共三章：
第一章基于第一ATG规则，统计了大肠杆菌和枯草杆菌基因组中已确定的基因和理论预测的基因其上游L-Ter到起始密码子的距离和L-Ter到起始密码子下游同相位紧邻ATG的距离，结果表明：L-Ter到起始密码子的距离主要分布在20个氨基酸以内；在以第一ATG和第一GTG为起始密码子的基因中，L-Ter到它下游同相位的紧邻ATG的距离是L-Ter到起始密码子平均距离的4～5倍，这些可能是起始密码子的重要位置特征，也说明了少数基因以GTG起始的主要原因。对于不满足第一ATG、GTG规则的基因，分析了L-Ter到起始密码子之间出现ATG、GTG和TTG的比率，发现大肠杆菌理论预测的基因与已确定的基因之间有较大的差别。
第二章采用信息聚类过程得到了SD序列特征强度强与弱两类，并对551个操纵子结构(含有两个以上基因的)中的SD序列进行研究，发现SD序列与操纵子结构、基因表达水平显著相关：操纵子结构中起始基因的SD序列特征强度弱于操纵子内的基因；SD序列的强度与基因表达水平成正相关。分别研究了大
肠杆菌中有SD序列特征的基因和无SD序列特征的基因，线虫和酵母基因组中
的L一... |
| 【论文题纲】 |
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序言 |
6-8 |
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一、 大肠杆菌和枯草杆菌的L-Ter到起始密码子的距离分析 |
8-16 |
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(一) 、 引言 |
8 |
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(二) 、 数据的选取 |
8-9 |
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(三) 、 L-Ter到起始密码子距离的统计 |
9-14 |
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(四) 、 讨论 |
14-16 |
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二、 大肠杆菌SD序列与操纵子结构、基因表达水平以及L-Ter到起始密码子距离分布的关系 |
16-24 |
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(一) 、 引言 |
16 |
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(二) 、 计算SD序列的强度 |
16-18 |
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(三) 、 SD序列的强度与操纵子结构和基因表达水平的关系 |
18-20 |
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(四) 、 SD序列对L-ter到起始密码子距离分布的影响 |
20-22 |
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(五) 、 讨论 |
22-24 |
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三、 大肠杆菌紧邻基因的关联与基因表达水平的关系 |
24-31 |
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(一) 、 引言 |
24 |
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(二) 、 基因组中基因的分类 |
24-25 |
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(三) 、 基因间关联强度分析 |
25-27 |
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(四) 、 基因间关联模式的统计分析 |
27-29 |
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(五) 、 讨论 |
29 |
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(六) 、 操纵子中不同表达类型的基因对的研究 |
29-31 |
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参考文献 |
31-34 |
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英文摘要 |
34-36 |
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攻读硕士学位期间发表的学术论文 |
36 |
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| 【DOI】 | LunWen.ID:2.2008.28157 |
