川西南高山峡谷区核桃资源的RAPD研究
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川西南高山峡谷区核桃资源的RAPD研究
作者:邹雪梅 Publish: 2006-11-1 Hits:-
【中文题名】 川西南高山峡谷区核桃资源的RAPD研究
【英文题名】 Random Amplifies Polymorphic DNA (RAPD) Studies on Walnut Resource Which Belong to Mountain and Ravine Region of Southwest Sichuan
【学科专业】 森林培育
【论文级别】 硕士论文
【投稿时间】 2006-11-1
【中关键词】 川西南高山峡谷区,核桃,RAPD分析,聚类分析,遗传多样性,
【英关键词】 mountain and ravine region of southwest Sichuan,Walnut,RAPD analysis,clustering analysis,Genetic diversities,
【分类导航】 农业科学>园艺>果树园艺>坚果类(壳果类)>核桃(胡桃)>
【论文摘要】 本研究利用随机多态性DNA(RAPD)技术对川西南高山峡谷区的核桃资源进行研究,所选用的109个样本分别来自两州一市的七个县(甘孜州:巴塘县、乡城县、得荣县;凉山州:会理县、美姑县、木里县;雅安市:石棉县)。本试验对扩增反应程序中退火温度和反应体系进行优化。用了120条引物进行初筛与复筛,得到14条随机引物用于聚类分析,建立了UMPGA聚类分析图。结果如下: 1.采用核沉淀法从核桃叶片中提取基因组DNA,经检测表明,核沉淀法能有效的去除核桃细胞内多糖和多酚等杂质对模板DNA的污染,获得的DNA纯度高,可进一步用于核桃分子生物学的操作。 2.着重对影响RAPD-PCRN重复的主要因子和参数进行优化研究,即对Taq DNA聚合酶、Mg~(2+)浓度、模板DNA浓度、引物浓度、dNTPs以及PCR扩增中的退火温度进行不同的梯度实验。结果表明如下反应程序和反应体系时扩增效果好、重复性好。建立了适于核桃分子标记的RAPD-PCR反应体系,为该树种进一步的分子生物学研究奠定基础。 反应程序:94℃预变性5min;94℃变性45s;35℃退火45s;72℃延伸90s;40个循...
【论文题纲】
1 引言 9-10
2 文献综述 10-19
2.1 RAPD技术的原理及其优缺点 10-11
2.1.1 RAPD技术的原理 10
2.1.2 RAPD随机扩增的原理 10-11
2.1.3 RAPD能检测多态性的原理 11
2.1.4 RAPD标记的优缺点 11
2.2 RAPD在果树种质资源研究中的应用 11-17
2.2.1 种质资源起源与进化的研究 11-12
2.2.2 种质资源遗传多样性和资源保存的研究 12-13
2.2.3 品种鉴定 13
2.2.4 亲子关系的确定 13-14
2.2.5 果树芽变的鉴定 14
2.2.6 果树分类研究 14-15
2.2.7 一些重要农艺形状的研究及分子标记的筛选 15-16
2.2.8 构建分子标记遗传图谱及分子标记辅助育种的早期选择 16-17
2.2.9 标记的遗传性 17
2.3 核桃种质资源研究的现状 17-18
2.4 研究目的及意义 18-19
3 实验材料和方法 19-26
3.1 实验材料 19-23
3.2 主要试剂及设备 23
3.2.1 主要试剂 23
3.2.2 主要仪器设备 23
3.3 实验方法 23-24
3.3.1 DNA提取的方法 23-24
3.3.2 DNA纯度和浓度的测定 24
3.3.3 DNA模板的电泳检测 24
3.3.4 PCR扩增体系的建立 24
3.4 扩增引物的筛选 24-25
3.5 扩增结果的电泳 25
3.6 数据处理 25-26
3.6.1 RAPD扩增产物的分析与处理 25
3.6.2 遗传多样性分析 25-26
4 试验结果分析 26-39
4.1 基因组DNA提取结果的分析 26-27
4.2 核桃RAPD扩增程序和扩增体系的优化 27-30
4.2.1 退火温度的选择 27
4.2.2 RAPD扩增体系的优化 27-30
4.3 扩增引物的筛选 30-31
4.4 核桃的遗传多样性分析 31-39
4.4.1 多态位点百分比及其分布 31-34
4.4.2 聚类分析 34-39
5 讨论 39-40
5.1 核桃基因组DNA的提取 39
5.2 RAPD反应的稳定性及影响因素 39-40
5.3 核桃样本的聚类分析 40
6 结论: 40-42
参考文献 42-48
致谢 48-49
硕士期间发表的文章 49-50
附表 50-52
【DOI】 LunWen.ID:2.2008.159497
付费论文:有参考文献 300元
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