| 【中文题名】 | 川西南高山峡谷区核桃资源的RAPD研究 |
| 【英文题名】 | Random Amplifies Polymorphic DNA (RAPD) Studies on Walnut Resource Which Belong to Mountain and Ravine Region of Southwest Sichuan |
| 【学科专业】 | 森林培育 |
| 【论文级别】 | 硕士论文 |
| 【投稿时间】 | 2006-11-1 |
| 【中关键词】 | 川西南高山峡谷区,核桃,RAPD分析,聚类分析,遗传多样性, |
| 【英关键词】 | mountain and ravine region of southwest Sichuan,Walnut,RAPD analysis,clustering analysis,Genetic diversities, |
| 【分类导航】 | 农业科学>园艺>果树园艺>坚果类(壳果类)>核桃(胡桃)> |
| 【论文摘要】 | 本研究利用随机多态性DNA(RAPD)技术对川西南高山峡谷区的核桃资源进行研究,所选用的109个样本分别来自两州一市的七个县(甘孜州:巴塘县、乡城县、得荣县;凉山州:会理县、美姑县、木里县;雅安市:石棉县)。本试验对扩增反应程序中退火温度和反应体系进行优化。用了120条引物进行初筛与复筛,得到14条随机引物用于聚类分析,建立了UMPGA聚类分析图。结果如下:
1.采用核沉淀法从核桃叶片中提取基因组DNA,经检测表明,核沉淀法能有效的去除核桃细胞内多糖和多酚等杂质对模板DNA的污染,获得的DNA纯度高,可进一步用于核桃分子生物学的操作。
2.着重对影响RAPD-PCRN重复的主要因子和参数进行优化研究,即对Taq DNA聚合酶、Mg~(2+)浓度、模板DNA浓度、引物浓度、dNTPs以及PCR扩增中的退火温度进行不同的梯度实验。结果表明如下反应程序和反应体系时扩增效果好、重复性好。建立了适于核桃分子标记的RAPD-PCR反应体系,为该树种进一步的分子生物学研究奠定基础。
反应程序:94℃预变性5min;94℃变性45s;35℃退火45s;72℃延伸90s;40个循... |
| 【论文题纲】 |
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1 引言 |
9-10 |
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2 文献综述 |
10-19 |
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2.1 RAPD技术的原理及其优缺点 |
10-11 |
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2.1.1 RAPD技术的原理 |
10 |
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2.1.2 RAPD随机扩增的原理 |
10-11 |
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2.1.3 RAPD能检测多态性的原理 |
11 |
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2.1.4 RAPD标记的优缺点 |
11 |
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2.2 RAPD在果树种质资源研究中的应用 |
11-17 |
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2.2.1 种质资源起源与进化的研究 |
11-12 |
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2.2.2 种质资源遗传多样性和资源保存的研究 |
12-13 |
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2.2.3 品种鉴定 |
13 |
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2.2.4 亲子关系的确定 |
13-14 |
|
2.2.5 果树芽变的鉴定 |
14 |
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2.2.6 果树分类研究 |
14-15 |
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2.2.7 一些重要农艺形状的研究及分子标记的筛选 |
15-16 |
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2.2.8 构建分子标记遗传图谱及分子标记辅助育种的早期选择 |
16-17 |
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2.2.9 标记的遗传性 |
17 |
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2.3 核桃种质资源研究的现状 |
17-18 |
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2.4 研究目的及意义 |
18-19 |
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3 实验材料和方法 |
19-26 |
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3.1 实验材料 |
19-23 |
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3.2 主要试剂及设备 |
23 |
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3.2.1 主要试剂 |
23 |
|
3.2.2 主要仪器设备 |
23 |
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3.3 实验方法 |
23-24 |
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3.3.1 DNA提取的方法 |
23-24 |
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3.3.2 DNA纯度和浓度的测定 |
24 |
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3.3.3 DNA模板的电泳检测 |
24 |
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3.3.4 PCR扩增体系的建立 |
24 |
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3.4 扩增引物的筛选 |
24-25 |
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3.5 扩增结果的电泳 |
25 |
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3.6 数据处理 |
25-26 |
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3.6.1 RAPD扩增产物的分析与处理 |
25 |
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3.6.2 遗传多样性分析 |
25-26 |
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4 试验结果分析 |
26-39 |
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4.1 基因组DNA提取结果的分析 |
26-27 |
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4.2 核桃RAPD扩增程序和扩增体系的优化 |
27-30 |
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4.2.1 退火温度的选择 |
27 |
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4.2.2 RAPD扩增体系的优化 |
27-30 |
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4.3 扩增引物的筛选 |
30-31 |
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4.4 核桃的遗传多样性分析 |
31-39 |
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4.4.1 多态位点百分比及其分布 |
31-34 |
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4.4.2 聚类分析 |
34-39 |
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5 讨论 |
39-40 |
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5.1 核桃基因组DNA的提取 |
39 |
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5.2 RAPD反应的稳定性及影响因素 |
39-40 |
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5.3 核桃样本的聚类分析 |
40 |
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6 结论: |
40-42 |
|
参考文献 |
42-48 |
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致谢 |
48-49 |
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硕士期间发表的文章 |
49-50 |
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附表 |
50-52 |
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| 【DOI】 | LunWen.ID:2.2008.159497 |