| 【中文题名】 | 大豆抗胞囊线虫相关基因的QTL定位 |
| 【英文题名】 | Mapping for Genes Conferring Resistance to Soybean Cyst Nematode |
| 【学科专业】 | 生物化学与分子生物学 |
| 【论文级别】 | 硕士论文 |
| 【投稿时间】 | 2007-8-29 |
| 【中关键词】 | 大豆,大豆胞囊线虫病,大豆遗传连锁图谱,抗性基因,遗传定位, |
| 【英关键词】 | Soybean,Soybean cyst nematode,Soybean genetic linkage map,Resistance gene,Genetic mapping, |
| 【分类导航】 | 农业科学>农作物>经济作物>油料作物>大豆> |
| 【论文摘要】 |
大豆胞囊线虫(Heterodera glycines Ichinohe,SCN)病是给大豆生产造成最严重危害的病害。据估计中国在2004年的损失是350万吨。大豆胞囊线虫危害大豆造成的产量下降是通过取食植株的营养物质,影响根的生长和固氮菌根瘤的形成.大豆(Glycine max (L)Merrill)对SCN的抗性遗传是受复杂的多基因控制的,牵涉到3-4个主效基因和多个微效基因。
本论文研究发展了一张大豆分子遗传连锁图谱,该图谱总图距为1951.8cM,相邻标记间的平均图距为5.48cM。图谱遗传连锁图归属20个连锁群对应于大豆20条染色体,连锁群长度范围从40.8cM到184.4cM,标记数范围从11到41个。利用图谱和抗性鉴定的结果共检测到3个QTLs,rhg-R4a1、rhg-R4a2在A2连锁群上,rhg-R4g1在G连锁群上。在G连锁群上的rhg-R4g1和已知的rhg1相似,可能是同一个基因座。根据蒺黎苜蓿的基因组序列数据设计了56对SSR引物,在大豆中鉴定出一个穿梭标记被定位在rhg-R4g1区间的一侧,这个区间在应县黑豆中抗大豆胞囊线虫4号小种。
我们建立了rhg-R... |
| 【论文题纲】 |
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中文摘要 |
5-6 |
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Abstract |
6-8 |
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英文缩略语 |
8-9 |
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前言 |
9-10 |
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第一部分 文献综述 |
10-31 |
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1 大豆胞囊线虫抗性的经典遗传学研究 |
10-11 |
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2 大豆抗胞囊线虫基因的分子标记和分子定位 |
11-13 |
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3 大豆遗传连锁图谱研究进展 |
13-23 |
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3.1 大豆的基因组学研究 |
14-15 |
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3.2 大豆经典图谱的研究 |
15 |
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3.3 以RFLP标记为主的大豆分子遗传图谱 |
15-21 |
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3.5 国内构建的大豆遗传连锁图谱 |
21-23 |
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4 豆科比较基因组学研究进展 |
23-25 |
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4.1 豆科比较基因组学研究 |
23 |
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4.2 豆科物种中的宏观共线性研究 |
23-24 |
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4.3 豆科物种中的微观共线性研究 |
24-25 |
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5 大豆RGA的研究进展 |
25-27 |
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5.1 植物抗病基因类似产物的保守结构 |
25-26 |
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5.2 大豆抗病基因在大豆基因组中的定位 |
26 |
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5.3 大豆抗病基因类似物在大豆基因组中的分布 |
26-27 |
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6 大豆EST研究进展 |
27-28 |
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7 研究目的、意义、内容、方法和技术路线 |
28-31 |
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7.1 目的、意义 |
28-29 |
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7.2 研究内容 |
29 |
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7.3 研究方法 |
29-30 |
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7.4 技术路线 |
30-31 |
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第二部分 大豆遗传连锁图谱中A2和G两连锁群的重建 |
31-39 |
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1 实验材料与研究方法 |
31-35 |
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1.1 作图群体 |
31-32 |
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1.2 SSR引物 |
32 |
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1.3 DNA提取及SSR引物PCR扩增 |
32-35 |
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1.4 数据分析 |
35 |
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2 结果与分析 |
35-39 |
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2.1 大豆分子遗传图的整合 |
35-36 |
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2.2 大豆分子遗传图中A2和G两个连锁群得到饱和 |
36-39 |
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第三部分 SCN抗性的QTL定位 |
39-44 |
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1 材料与方法 |
39-40 |
|
1.1 材料 |
39 |
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1.2 方法 |
39-40 |
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2 结果与分析 |
40-42 |
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2.1 晋豆23×ZDD2315组合的F2遗传群体抗虫性状鉴定数据的分析 |
40-41 |
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2.2 SCN4号生理小种的抗性座位的QTL定位和效应分析 |
41-42 |
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3 讨论 |
42-44 |
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3.1 利用已知分子遗传连锁图谱对目标性状进行分子标记 |
42-43 |
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3.2 利用QTL分析法对大豆胞囊线虫的抗性座位的定位 |
43-44 |
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第四部分 穿梭标记(Cross-speciesmarker)的获得 |
44-53 |
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1 引言 |
44 |
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2 穿梭SSR的开发路线 |
44-45 |
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3 开发SSR穿梭标记的研究基础 |
45-49 |
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4 实验材料和方法 |
49-50 |
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4.1 实验材料 |
49 |
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4.2 方法 |
49-50 |
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5 实验结果与分析 |
50-53 |
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5.1 设计的SSR标记的多态性筛选和上群体结果 |
50-51 |
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5.2 多态性标记上群体的结果与分析 |
51-53 |
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第五部分 穿梭标记附近基因的in silico分析 |
53-57 |
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1 实验材料与方法 |
53-54 |
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2.结果与分析 |
54-57 |
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结论 |
57-58 |
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附录 |
58-76 |
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参考文献 |
76-80 |
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发表论文 |
80-81 |
|
致谢 |
81-83 |
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| 【DOI】 | LunWen.ID:2.2008.155866 |