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中国飞蝗属9个自然种群的RAPD分析及其种群遗传学研究

作者：任俐 Publish: 2005-8-31 Hits:-

【中文题名】

中国飞蝗属9个自然种群的RAPD分析及其种群遗传学研究

【英文题名】

Studies on the Genetic Divergence and Population Genetics of Nine Populations of Locusta Migratoria in China by RAPD

【学科专业】

动物学

【论文级别】

硕士论文

【投稿时间】

2005-8-31

【中关键词】

关键词飞蝗,种群,RAPD,遗传多样性,聚类图,

【英关键词】

Locusta migratoria,populations,RAPD,genetic diversity,dendrogram,

【分类导航】

生物科学>昆虫学>昆虫遗传学>>>

【论文摘要】

随机扩增多态DNA技术(简称RAPD)是二十世纪90年代发展起来的一项DNA分子多态检测技术,它建立在PCR技术基础上,以一系列不同随机排列的碱基序列—单链寡核苷酸为引物—对所研究的基因组DNA进行PCR扩增。该技术能够在没有任何遗传背景的情况下,对物种基因组进行DNA多态性分析。它不但能通过众多的引物检测大量的基因位点,且具有高效、快速、样品用量少和对材料要求不高等优点,目前已广泛应用于动植物的遗传多样性研究中。飞蝗是直翅目中较大的一个类群,它广泛分布于各种生态环境中,由于食性及环境条件的适应,形成了不同的生态型和自然地理种群。长期隔离和演化的结果,同种蝗虫不同种群之间逐渐产生了一定的遗传分化。飞蝗引起的蝗灾是我国农业历史上重大的自然灾害,本文的研究工作为我国飞蝗种群遗传学的研究提供了丰富的资料。本文采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术检测了飞蝗Locusta migratoria(Linnaeus)9个自然种群的遗传多样性及遗传分化。用筛选的11条随机引物对飞蝗的9个种群113个个体进行扩增,共获得163个清晰稳定的条带,多态位点共计161个,总的多态位点百分率为98.77...

【论文题纲】

中文摘要	6-8
英文摘要	8-12
第一章引言	12-26
1.1 东亚飞蝗研究概况	12-16
1.1.1 东亚飞蝗的生物学特性	12
1.1.2 东亚飞蝗的地理分布及其基本特征	12-14
1.1.2.1 东亚飞蝗的地理分布	12-13
1.1.2.2 东亚飞蝗分布的基本特征	13-14
1.1.3 东亚飞蝗发生区的生态类型	14-15
1.1.4 国内外东亚飞蝗研究进展	15-16
1.2 DNA分子多态性的检测方法	16-19
1.3 RAPD分子标记技术	19-23
1.3.1 RAPD的原理和特点	19-21
1.3.2 RAPD技术的应用范围	21-22
1.3.2.1 品种(杂种)真实性鉴定	21
1.3.2.2 生物多样性研究	21
1.3.2.3 分子标记辅助选择	21-22
1.3.2.4 遗传易感性疾病的分析	22
1.3.2.5 估计群体的遗传距离、个体亲缘关系和系统演化的分析	22
1.3.3 RAPD技术在蝗总科分子系统学研究中的应用	22-23
1.4 分子系统研究中常用的分析软件包	23-24
1.5 本文研究的目的和意义	24-26
第二章材料和方法	26-32
2.1 实验器材和试剂	26
2.1.1 实验器材	26
2.1.2 实验试剂	26
2.2 供试种群	26-27
2.3 研究方法	27-32
2.3.1 基因组DNA的提取及检测	27-29
2.3.1.1 饱和氯化钠法提取总DNA	27-28
2.3.1.2 酚-氯仿法提取总DNA	28
2.3.1.3 DNA样品的检测(0.8％琼脂糖凝胶电泳检测)	28-29
2.3.2 引物的筛选	29-30
2.3.3 RAPD-PCR扩增及检测	30-31
2.3.3.1 RAPD-PCR扩增	30
2.3.3.2 扩增结果检测与记录	30-31
2.3.4 数据统计与分析	31-32
2.3.4.1 多态位点比率P	31
2.3.4.2 Shannon-wever信息指数	31
2.3.4.3 Nei's基因多样性指数H和遗传分化系数G_(ST)(Nei)	31
2.3.4.4 遗传距离和聚类分析	31-32
第三章实验结果	32-43
3.1 总DNA提取和RAPD-PCR扩增	32-34
3.1.1 总DNA提取	32
3.1.2 RAPD-PCR扩增	32-34
3.1.2.1 RAPD图谱统计结果	33-34
3.2 数据分析	34-43
3.2.1 多态位点百分率	34
3.2.2 遗传多样性	34-38
3.2.2.1 Shannon信息指数估算的东亚飞蝗遗传多样性和遗传分化	34-36
3.2.2.2 Nei's指数估测的东亚飞蝗种群基因多样性和遗传分化	36-38
3.2.3 遗传距离和遗传一致度	38-39
3.2.4 Mantel软件处理的飞蝗种群内和种群间的遗传距离	39-40
3.2.5 聚类分析	40-43
第四章讨论	43-56
4.1 基因组DNA的提取	43-44
4.1.1 取样及样本保存方式	43
4.1.2 酚-氯仿法和NaCl法比较	43
4.1.3 DNA分离的方法	43-44
4.1.4 DNA的浓度	44
4.2 引物及影响因素	44-47
4.2.1 引物设计	44-45
4.2.2 引物的浓度	45
4.2.3 扩增的条件	45-46
4.2.4 操作技术	46
4.2.5 RAPD标记稳定性的影响因素探析	46-47
4.3 聚类数据因素分析	47-48
4.4 RAPD-PCR扩增结果	48-53
4.4.1 RAPD-PCR的多态性	48-49
4.4.2 遗传多样性与遗传分化	49-50
4.4.3 遗传距离和聚类分析	50-51
4.4.4 东亚飞蝗种群的遗传结构与地理距离和遗传距离之间的关系	51-53
4.5 等位酶和RAPD分析结果的比较	53-54
4.6 展望	54-56
参考文献	56-65
致谢	65-66
攻读硕士学位期间论文相关情况	66-67
承诺	67

【DOI】

LunWen.ID:2.2008.34679



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